Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHAMP1Q96JM3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHAMP1Q96JM3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHAMP1Q96JM3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHAMP1Q96JM3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHAMP1Q96JM3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms