Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIC2Q96JB3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HIC2Q96JB3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIC2Q96JB3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIC2Q96JB3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms