Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD3Q96ES6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD3Q96ES6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MFSD3Q96ES6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD3Q96ES6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms