Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM19Q96E16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM19Q96E16 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM19Q96E16 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms