Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERP27Q96DN0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERP27Q96DN0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP27Q96DN0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP27Q96DN0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms