Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF653Q96CK0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF653Q96CK0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF653Q96CK0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF653Q96CK0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF653Q96CK0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF653Q96CK0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF653Q96CK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF653Q96CK0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF653Q96CK0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF653Q96CK0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF653Q96CK0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms