Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXOSC8Q96B26 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC8Q96B26 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC8Q96B26 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC8Q96B26 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms