Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNFRSF25Q93038 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNFRSF25Q93038 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNFRSF25Q93038 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFRSF25Q93038 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNFRSF25Q93038 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms