Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PROX1Q92786 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PROX1Q92786 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROX1Q92786 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PROX1Q92786 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PROX1Q92786 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROX1Q92786 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms