Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR4A3Q92570 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A3Q92570 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A3Q92570 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms