Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPDL3BQ92485 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMPDL3BQ92485 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1016.2 ms