Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSPC1Q8WXF1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSPC1Q8WXF1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PSPC1Q8WXF1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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