Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRIPQ8WXE1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ATRIPQ8WXE1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATRIPQ8WXE1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATRIPQ8WXE1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATRIPQ8WXE1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.1 ms