Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC44A1Q8WWI5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC44A1Q8WWI5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms