Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMCE1Q8WV22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NSMCE1Q8WV22 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSMCE1Q8WV22 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms