Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GRHL3Q8TE85 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRHL3Q8TE85 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRHL3Q8TE85 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRHL3Q8TE85 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms