Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB92

HMGCLL1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLL1Q8TB92 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGCLL1Q8TB92 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCLL1Q8TB92 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMGCLL1Q8TB92 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGCLL1Q8TB92 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms