Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCL4L1Q8NHW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCL4L1Q8NHW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCL4L1Q8NHW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL4L1Q8NHW4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms