Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP38Q8NB14 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP38Q8NB14 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP38Q8NB14 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP38Q8NB14 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP38Q8NB14 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP38Q8NB14 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP38Q8NB14 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP38Q8NB14 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP38Q8NB14 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP38Q8NB14 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP38Q8NB14 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP38Q8NB14 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP38Q8NB14 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP38Q8NB14 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
USP38Q8NB14 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP38Q8NB14 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP38Q8NB14 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP38Q8NB14 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP38Q8NB14 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP38Q8NB14 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
USP38Q8NB14 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP38Q8NB14 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
USP38Q8NB14 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP38Q8NB14 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP38Q8NB14 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP38Q8NB14 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP38Q8NB14 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP38Q8NB14 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP38Q8NB14 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.51■■■□□ 2
USP38Q8NB14 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP38Q8NB14 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP38Q8NB14 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms