Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M8

IQCF1, IQ domain-containing protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCF1Q8N6M8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IQCF1Q8N6M8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IQCF1Q8N6M8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IQCF1Q8N6M8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IQCF1Q8N6M8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms