Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
VWA5B2Q8N398 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA5B2Q8N398 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA5B2Q8N398 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VWA5B2Q8N398 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms