Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J6

FRMD5, FERM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD5Q7Z6J6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD5Q7Z6J6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD5Q7Z6J6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD5Q7Z6J6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD5Q7Z6J6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD5Q7Z6J6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
FRMD5Q7Z6J6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FRMD5Q7Z6J6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMD5Q7Z6J6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FRMD5Q7Z6J6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms