Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP1BQ7LBR1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP1BQ7LBR1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms