Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZD4Q76G19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDZD4Q76G19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDZD4Q76G19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDZD4Q76G19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms