Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP43Q70EL4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP43Q70EL4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP43Q70EL4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP43Q70EL4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms