Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP50Q70EL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP50Q70EL3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP50Q70EL3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP50Q70EL3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP50Q70EL3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP50Q70EL3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP50Q70EL3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP50Q70EL3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP50Q70EL3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms