Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC73Q6ZRK6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC73Q6ZRK6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC73Q6ZRK6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms