Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPNS3Q6ZMD2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPNS3Q6ZMD2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SPNS3Q6ZMD2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPNS3Q6ZMD2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms