Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CD109Q6YHK3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CD109Q6YHK3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CD109Q6YHK3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CD109Q6YHK3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CD109Q6YHK3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CD109Q6YHK3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CD109Q6YHK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
CD109Q6YHK3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CD109Q6YHK3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CD109Q6YHK3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CD109Q6YHK3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms