Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBLN3Q6UW01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN3Q6UW01 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBLN3Q6UW01 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBLN3Q6UW01 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms