Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S3Q6QNY0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S3Q6QNY0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S3Q6QNY0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S3Q6QNY0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S3Q6QNY0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BLOC1S3Q6QNY0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S3Q6QNY0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BLOC1S3Q6QNY0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BLOC1S3Q6QNY0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BLOC1S3Q6QNY0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BLOC1S3Q6QNY0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms