Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF449Q6P9G9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF449Q6P9G9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF449Q6P9G9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF449Q6P9G9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms