Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT80Q6KB66 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT80Q6KB66 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT80Q6KB66 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms