Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTRHD1Q6GMV3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTRHD1Q6GMV3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTRHD1Q6GMV3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTRHD1Q6GMV3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms