Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM68Q6AZZ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM68Q6AZZ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM68Q6AZZ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM68Q6AZZ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms