Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN13Q68D06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN13Q68D06 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLFN13Q68D06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLFN13Q68D06 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLFN13Q68D06 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms