Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG16L1Q676U5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG16L1Q676U5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG16L1Q676U5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms