Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF3Q5VWG9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF3Q5VWG9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF3Q5VWG9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF3Q5VWG9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms