Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTUD1Q5VV17 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTUD1Q5VV17 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
OTUD1Q5VV17 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTUD1Q5VV17 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms