Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP40Q5TG30 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP40Q5TG30 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP40Q5TG30 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP40Q5TG30 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP40Q5TG30 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGAP40Q5TG30 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP40Q5TG30 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGAP40Q5TG30 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGAP40Q5TG30 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms