Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
L1TD1Q5T7N2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
L1TD1Q5T7N2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
L1TD1Q5T7N2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
L1TD1Q5T7N2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
L1TD1Q5T7N2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
L1TD1Q5T7N2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
L1TD1Q5T7N2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
L1TD1Q5T7N2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
L1TD1Q5T7N2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
L1TD1Q5T7N2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
L1TD1Q5T7N2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
L1TD1Q5T7N2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
L1TD1Q5T7N2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
L1TD1Q5T7N2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms