Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF14Q5SWL7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF14Q5SWL7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF14Q5SWL7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF14Q5SWL7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF14Q5SWL7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF14Q5SWL7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms