Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH2D4BQ5SQS7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH2D4BQ5SQS7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4BQ5SQS7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms