Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MIA3Q5JRA6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIA3Q5JRA6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MIA3Q5JRA6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MIA3Q5JRA6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms