Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFAIP8L3Q5GJ75 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP8L3Q5GJ75 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms