Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIN52Q52LA3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIN52Q52LA3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIN52Q52LA3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms