Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CFAP221Q4G0U5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP221Q4G0U5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP221Q4G0U5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP221Q4G0U5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP221Q4G0U5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms