Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LONRF3Q496Y0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LONRF3Q496Y0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LONRF3Q496Y0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LONRF3Q496Y0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms