Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC153Q494R4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC153Q494R4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC153Q494R4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC153Q494R4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms