Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNPY1Q3B7I2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNPY1Q3B7I2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPY1Q3B7I2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPY1Q3B7I2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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